Pufferkonzentrationen sind ebenfalls wichtig. Es wird allgemein davon ausgegangen, dass Konzentrationen unter 10 mM nicht die Pufferkapazität bieten, die zur Kontrolle der Silanolaktivität oder des Ionisierungszustands einer Verbindung erforderlich ist. 10 mM werden als minimale effektive Konzentration für die Umkehrphase und HILIC angesehen. Für andere Techniken, wie z. B. den Größenausschluss, sind wesentlich höhere Konzentrationen erforderlich. Es ist nicht ungewöhnlich, dass für diese Methoden Konzentrationen von über 100 mM eingesetzt werden. Die Pufferkonzentration muss sorgfältig überlegt sein, um sicherzustellen, dass die Löslichkeit unter allen Bedingungen erreicht werden kann. Wenn Sie unter Reversed-Phase-Bedingungen arbeiten, müssen Sie möglicherweise die Konzentration des Puffers, mit dem Sie arbeiten möchten, begrenzen, wenn die Methode einen hohen Organikanteil enthält (z. B. bei einem Gradienten), um sicherzustellen, dass der Puffers nicht ausfällt.