Uwaga: Kolumny GC nie mają określonego przez producenta kierunku przepływu. Przy pierwszym użyciu nowej kolumny GC zaleca się oznaczenie jednego końca kolumny do instalacji w porcie. Jest to szczególnie ważne w przypadku związków aktywnych/żrących lub zanieczyszczających. Jeśli te związki są rutynowo nastrzykiwane na kolumnę, nastąpuje degradacja fazy stacjonarnej, co prowadzi do zwiększonego wymywania fazy. W takich sytuacjach pierwszym krokiem do naprawienia tego problemu byłoby przycięcie 10 cm z początku kolumny i dalsze przycinanie, jeśli sytuacja się powtarza. Ta procedura może nie być skuteczna, jeśli będziemy zamieniać kierunek przepływu, odwracać kolumnę i przycinać ją z obu końców.